SnapGene是一款非常專業(yè)的分子生物學分析軟件。它的功能十分強大，為用戶提供完善的計劃，可視化和記錄您的日常分子生物學程序的解決方案，節(jié)省了大量的時間和金錢，容易操作的可視化和模擬，該版本內置破解補丁，用戶破解之后，可永久免費使用。

【功能特點】

　　成對對齊：可以通過局部，全局或半全局比對來分析成對的DNA或蛋白質序列。

　　從Ensembl導入：現(xiàn)在可以將來自Ensembl基因組瀏覽器的基因或轉錄數(shù)據(jù)直接導入SnapGene。

　　定向TOPO?克?。阂粋€新的界面可以模擬定向TOPO?克隆到拓撲異構酶激活的載體中。

　　靈活對齊參考：與參考DNA序列比對的界面已得到增強。各種顯示選項的控件更加直觀，并且可以將比對限制在參考序列的指定鏈或區(qū)域內。

　　可拖動的不對齊端：對于已與參考DNA序列部分比對的序列，現(xiàn)在可以將未比對的末端部分拖出并可視化。

　　AnzaTM酶：Thermo Fisher（Invitrogen）的AnzaTM酶系統(tǒng)已整合到SnapGene的酶數(shù)據(jù)庫中。

　　DNA到蛋白質的比對轉換：可以翻譯DNA比對的選定區(qū)域以產生相應的蛋白質比對。

　　比對cDNA的內含子注釋：當cDNA與參考基因組DNA序列比對時，該cDNA可用于創(chuàng)建一個特征，其中的缺口被注釋為內含子。

【軟件特色】

　　一、想象

　　1、DNA可視化

　　查看DNA序列的多個視圖。

　　地圖 · 序列 · 酶 · 特征 · 引物 · 歷史

　　自定義酶位點，特征，引物，ORF，DNA顏色等的顯示。地圖可以是圓形或線性格式。

　　使用雙鏈模式查看酶位點，具有翻譯，引物和DNA顏色的特征。單鏈模式顯示具有彩色特征的緊湊概覽。

　　從一系列酶組中選擇。剪切網站可以顯示為數(shù)字或行，按名稱或頻率排序。

　　按名稱，位置，大小，顏色，方向性或類型對帶注釋的要素列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

　　按名稱，長度，顏色，結合位點，方向性或解鏈溫度對雜交引物列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

　　查看DNA構建體的自動生成的圖形歷史記錄。祖先序列可以作為單獨的文件恢復

　　2、大序列支持

　　瀏覽染色體大小序列。

　　查看 · 搜索 · 縮放

　　利用SnapGene的高效數(shù)據(jù)處理功能，掃描具有數(shù)千種注釋功能的大型DNA序列。

　　使用專有的MICA算法立即在染色體內找到序列。

　　使用多功能控件調整縮放系數(shù)和顯示區(qū)域。

　　3、蛋白質可視化

　　查看蛋白質序列的多個視圖。

　　地圖 · 序列 · 屬性 · 特征 · 歷史

　　自定義區(qū)域，站點，鍵和序列顏色的顯示。

　　使用具有相關特征的1-或3個字母的氨基酸代碼查看蛋白質序列。

　　查看蛋白質的分子量，消光系數(shù)，等電點和氨基酸組成?？梢詫Φ鞍踪|的選定部分進行相同的分析。

　　按名稱，位置，大小，顏色或類型對帶注釋的功能列表進行排序。復選框在緊湊或完全展開的顯示之間切換。

　　查看自動生成的蛋白質序列圖形歷史記錄。祖先蛋白質或DNA序列可以作為單獨的文件再生。

　　4、直觀的序列編輯

　　輕松編輯DNA和蛋白質序列。

　　標準編輯 · DNA結束

　　進行插入，刪除，替換和大小寫更改。復制并粘貼序列時，會自動傳輸功能。

　　編輯線性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯。

　　5、序列顏色編碼

　　將選定的DNA或氨基酸序列設置為十種顏色之一。

　　給兩條DNA鏈或蛋白質序列著色。顏色在Map和Sequence視圖中都可見。

　　6、特征注釋

　　自動注釋常用功能，或手動注釋新功能。

　　自動特征檢測 · 手動特征注釋

　　使用SnapGene廣泛的數(shù)據(jù)庫查找DNA序列中的常見特征。您選擇的其他功能可以添加到自定義數(shù)據(jù)庫中。

　　選擇DNA或蛋白質序列的一部分，并使用靈活的GenBank兼容控件注釋特征。

　　二、模擬

　　1、限制性站點指標

　　確認限制性網站適合克隆。

　　獨特性 · 甲基化敏感性 · 特殊性質

　　以粗體顯示獨特的限制性位點，或選擇自動定義的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶組。

　　不要被愚弄，因為限制性位點被Dam，Dcm或EcoKI甲基化阻斷。SnapGene將自動用星號標記該站點。

　　利用工具提示來避免有問題的限制網站。

　　2、限制性克隆

　　可視化克隆過程的所有方面。

　　如果您已經考慮過程，則模擬只需幾秒鐘。如果克隆過程存在設計缺陷，則可以捕獲并糾正錯誤。

　　3、PCR

　　模擬標準PCR。

　　使用您自己的引物，或要求SnapGene自動設計引物。產品文件在其歷史記錄中存儲模板和引物。

　　4、重疊延伸PCR

　　通過重疊延伸PCR融合片段

　　最多可組裝八個碎片。選擇要連接的片段及其方向，SnapGene將設計引物。

　　5、引物定向誘變

　　使用誘變引物進行定點誘變。

　　選擇誘變引物，按下按鈕查看修飾的質粒。歷史顏色突出了突變。

　　6、網關？克隆

　　模擬網關？ BP克隆或LR克隆，或兩者在同一時間。

　　為方便起見，提供了常見的供體向量和目的向量。選擇要組裝的片段，SnapGene將設計引物。

　　7、吉布森大會？

　　通過融合多達八個片段或通過將多達八個片段插入向量來模擬Gibson Assembly。Gibson Assembly是一種流行的無縫克隆方法。

　　選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產生。

　　8、IN-FUSION ?克隆

　　通過在向量中插入最多八個片段來模擬Clontech的In-Fusion克隆。In-Fusion克隆是一種非常通用的方法，可用于創(chuàng)建無縫基因融合。

　　選擇要融合的片段及其方向，SnapGene將設計引物。線性化的載體可以通過酶消化或反向PCR產生。

　　9、TA和GC克隆

　　通過TA或GC克隆捕獲PCR產物。

　　選擇傳統(tǒng)的TA克隆或高效GC克隆。

　　為方便起見，提供了常見的TA克隆載體和Lucigen的GC克隆載體。

　　10、退火Oligos

　　退火兩個寡核苷酸形成雙鏈產物。

　　使用簡單的控件添加突出限制克隆。

　　三、避免錯誤

　　使用SnapGene，確保構造符合您的要求，并確認您獲得了所需的序列。

　　1、閱讀基因融合的框架

　　確保構造中的已轉換要素符合框架。

　　鏈接翻譯 · 警告信息

　　使用“序列”視圖可以快速查看兩個已翻譯的要素是否在框架中。如果是這樣，翻譯鏈接在同一行。如果不是，則翻譯在單獨的行上。

　　2、與參考序列對齊

　　使用強大的對齊工具檢查實際構造是否與模擬構造匹配。

　　地圖概述 · 序列詳細信息

　　請參閱對齊序列與參考序列匹配的位置的概述，以及存在差異的位置。

　　四、自動錄制

　　SnapGene自動記錄操作以創(chuàng)建圖形歷史記錄，并將祖先結構存儲在最終文件中。

　　1、全面的“撤銷”能力

　　幾乎撤消任何操作。

　　不要害怕嘗試使用SnapGene文件 - 回溯您的步驟很容易。

　　2、歷史和嵌入式祖先

　　查看構造的圖形歷史記錄。

　　單擊操作以突出顯示親本和產物序列的相關部分，或單擊PCR引物名稱以查看引物序列。

　　單擊歷史記錄樹中的祖先以重新生成該祖先序列文件，包括其注釋和克隆歷史記錄。

　　3、歷史色彩

　　使用可選的歷史記錄顏色來標識序列的最新更改。

　　詳細了解構建體的組裝方式，包括結扎的粘性末端。

　　五、擁有你的數(shù)據(jù)

　　SnapGene允許您根據(jù)需要閱讀和共享文件，同時保持對數(shù)據(jù)的完全控制。

　　1、安全文件管理

　　將SnapGene文件保存在所需的位置。

　　使用熟悉的安全操作系統(tǒng)來存儲和整理SnapGene文件。

　　2、從其他格式導入

　　閱讀許多常見的文件格式。

　　不僅可以導入DNA序列，還可以導入注釋和注釋。我們將繼續(xù)開發(fā)進口商，以確保您不會被鎖定為專有文件格式。

　　3、導出為標準格式

　　將序列，地圖或凝膠圖像轉換為標準格式，以便與其他軟件一起使用。

　　將序列導出為GenBank或FASTA格式。將地圖或模擬瓊脂糖凝膠導出為常見的圖像格式。

　　4、使用SnapGene Viewer共享數(shù)據(jù)

　　將SnapGene格式的文件發(fā)送給可以下載免費SnapGene Viewer的同事或客戶。

　　只需將文件與鏈接一起發(fā)送到SnapGene Viewer即可。收件人將能夠看到地圖，序列和注釋，就像在完整的SnapGene界面中一樣。

　　5、對于開發(fā)人員

　　要將SnapGene整合到您的數(shù)據(jù)分析或實驗室管理軟件中，請聯(lián)系我們以獲取有關如何讀取和寫入SnapGene文件的信息。

　　六、轉換文件格式

　　開放式信息交換至關重要，因此SnapGene和SnapGene Viewer提供了讀取和導出常見文件格式的選項。

　　從其他格式導入時，目標不僅是捕獲DNA序列，還捕獲注釋和注釋

　　新功能介紹

　　1、重疊群大會

　　線性或環(huán)狀重疊群可以從重疊序列或Sanger序列跡線重新組裝。

　　2、靈活的對齊

　　現(xiàn)在可以以各種方式導入要對齊的序列?？梢蕴崛《鄠€對齊的一部分以生成新的多重對齊，或者可以編輯現(xiàn)有的多個對齊以添加或移除由不同算法生成的對齊。

　　3、Nicking Enzymes

　　可以顯示Nicking核酸內切酶。當選擇跨越從線性序列的末端到切口核酸內切酶位點時，可以通過按Delete刪除該單鏈區(qū)域。

　　4、點特征

　　現(xiàn)在，DNA序列支持零長度點功能，并在從GenBank，MacVector或Gene Construction Kit導入文件時識別。

　　5、酶網站突出顯示

　　常用的酶位點可以用黃金突出顯示，以便快速識別。

　　6、協(xié)調一致性增強

　　多重比對的共識序列具有改進的格式，現(xiàn)在可以復制或導出。

　　7、用于與參考序列對齊的存儲編輯

　　根據(jù)流行的需求，當通過調整比對序列的端點編輯與參考DNA序列的比對時，保留和恢復那些編輯。

　　8、從其他文件格式導入功能

　　可以將特征導入到BED，GFF3或GTF格式的DNA序列中。

　　9、從UniProt導入

　　可以從UniProt數(shù)據(jù)庫導入蛋白質序列記錄。

　　10、進口基因組編譯器項目

　　現(xiàn)在可以在SnapGene中直接打開Genome Compiler項目文件（。gcproj）。對于施工項目文件，在“歷史記錄”視圖中捕獲施工歷史。

　　11、引物添加日期

　　將引物添加到文件時，會記錄日期。引物可按添加日期排序。

　　12、讀取和寫入對齊文件格式

　　SnapGene可以將對齊導入SAM / BAM和VectorNTI?.cep格式的參考序列，并可以將對齊導出為SAM / BAM格式的參考序列。

【破解說明】

　　1、雙擊SnapGene.exe，安裝軟件

　　2、軟件安裝完成后，直接替換SnapGene.exe

　　默認路徑C:\Program Files （x86）\SnapGene

　　3、安裝破解完成，Enjoy

　　注冊信息無需理會，實際是已破解